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找到基因組的“原主”

點(diǎn)擊次數(shù):370 發(fā)布時(shí)間:2013/2/27
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找到基因組的“原主”
基因組測序技術(shù)的發(fā)展,促使越來越多個(gè)體基因組序列被測定,不知大家有沒有留意過這些樣品來源的志愿者,不過現(xiàn)在Whitehead生物醫(yī)藥研究院的一組研究人員指出通過簡單的網(wǎng)絡(luò)搜索,就可以找到這些捐贈(zèng)DNA的匿名志愿者了。

這項(xiàng)發(fā)表于1月18日Science雜志上的研究成果引發(fā)了諸多爭論,作者認(rèn)為,讓科學(xué)家們難以利用到個(gè)人基因組資料,會(huì)阻礙科學(xué)的進(jìn)步,其實(shí)重點(diǎn)應(yīng)該在于教育捐贈(zèng)者有關(guān)遺傳學(xué)研究的風(fēng)險(xiǎn)和好處,并且制定恰當(dāng)使用這些遺傳學(xué)信息的法規(guī)。

*這一研究的是Whitehead生物醫(yī)藥研究院計(jì)算遺傳學(xué)家Yaniv Erlich,他表示,參與公共測序項(xiàng)目的志愿者們一般都被告知,這種匿名性并沒有100%的保證,但其身份被泄露的風(fēng)險(xiǎn)很小,可以忽略不計(jì)。

然而,在一篇發(fā)表于2005年的華盛頓郵報(bào)新聞中,一個(gè)十幾歲的男孩通過在線族譜搜索工具,找到了其精子捐贈(zèng)的父親,這說明這種風(fēng)險(xiǎn)性可能還是比較高的。這篇新聞報(bào)道稱,這個(gè)男孩將其DNA樣品提交給了一個(gè)家譜搜索服務(wù)部門,后者利用男孩的Y染色體中的重復(fù)序列,在自己的序列數(shù)據(jù)庫中尋找想匹配的人,雖然這個(gè)搜索并沒有直接找到他父親,但是卻搜索出了兩名同姓的男子。追蹤這個(gè)信息,男孩就能找到并上他的父親。

“我們聽說了這個(gè)故事,就想,哇,這可能是對個(gè)體基因組(隱私)的一個(gè)威脅,”Erlich說。

為了驗(yàn)證要找到DNA捐贈(zèng)者的身份是否十分容易,Erlich研究組了能從全基因組序列中檢索Y染色體重復(fù)的軟件,通過尋找這些重復(fù)序列,他們就能進(jìn)行家譜搜索了。“然后我們就想,嘗試一下Craig Vente的基因組搜索吧,結(jié)果它起作用了!”

中搜索可用的家譜序列數(shù)據(jù)庫,果然,通過這一迄今為止zui強(qiáng)的匹配,他們找到了來自英格蘭林肯郡的Venter,將這個(gè)姓氏,與Craig Venter的年齡和居住地結(jié)合起來(這兩種信息一般與匿名人基因組序列一起公布),然后研究人員利用網(wǎng)上公開記錄,,就將范圍縮減到了兩個(gè)人,其中一個(gè)就是Craig Vente。

之后他們通過進(jìn)一步以實(shí)驗(yàn),利用他們的軟件搜索DNA序列的志愿者,通過年齡和所在地的匹配對每一個(gè)姓氏可能的個(gè)人進(jìn)行了確認(rèn),結(jié)果確定了大約50名志愿者的身份。Erlich說,“zui重要的一點(diǎn),是一切都公開。我們沒有入侵任何數(shù)據(jù)庫,我們也不需要任何特殊的密碼。”

雖然要識(shí)別某個(gè)人的身份的幾率依然很低,但是這項(xiàng)研究提出了是否還需更多注意捐贈(zèng)者意思的問題,不過來自哈佛醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)教授George Church(未參與該項(xiàng)試驗(yàn))表示,這沒有多大意義,“可以嘗試修改協(xié)議”,比如保留參加者年齡等信息,“但是這只是蒙上一層紗布,zui終還是很容易找到他們,”他說。

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